请问 DNA／遗传方面的简单的计算有哪些？

[20015jjw]

要重写一个CS课的Lab作业... Lab的主题是LinkedList... 然后... 因为学生觉得不好玩... 要给他上个主题... 然后有个小胖子说DNA的吧... Instructor就同意了... 做助教真难...

所以求问大家>< 有什么简单一点的不需要太多背景解释的就能做的计算... 我就学过苏教的高中生物我啥都不知道啊 @生物班主任对不起你了...

[baskice]

跑DNA我想不出有啥能用Link List的，随便跑跑都是几个G的数据，Link List 还不疯了。

你可以假设bio院有个教授想仿照 https://fold.it/portal/ 做个简单的折蛋白小游戏当作作业。从cs随便抓了几个学生让他们做。

然后你就可以设置规则了，二十个AA(amino acids)学生要以特定顺序连接才能成功折叠。

之后可以玩的方法就很多了，比如让学生创建Link List （以特定顺序连接几个AA）

然后Link List头尾添加内容，中间添加和删除（蛋白质修饰，头尾添加，头尾以及中间切除AA）

额外功能读取特定位置数据 （检测特殊位点AA是否正确，比如第7,13,19什么的）

要想作难一些可以要求学生把带正电和带负电的配对，亲水的放在特定区域疏水的放在特定区域什么的……
可以给他们提供这张图作参考
https://en.wikipedia.org/wiki/Amino_acid#/media/File:Amino_Acids.svg

以上方法当然能改成DNA修饰，不过bio的学生多半会觉得很怪异。如果你没有多少bio major的小兔崽子，那随便乱写就是了……

[20015jjw]

@baskice 第一个貌似很好玩 求参考资料什么的qwq 生物小白啥都不造根本看不懂qwq 谢谢！