请教大佬们如何用 pandas 高效读取被分片的 csv 文件

2021-02-07 16:24:39 +08:00
 sdushn

背景

使用 pandas 库处理一个性能参数的 csv 文件,但是 csv 文件是分片的,格式如下

time A B C D
20:00 0 1 2 3
time E F G H
20:00 4 5 6 7
...

现在想读成如下格式,存成一个 dataframe 便于下游继续处理

time A B C D E F G H ...
20:00 0 1 2 3 4 5 6 7 ...

现在方案及问题

现在是通过跳过 n 行读取,然后拼接的方案,会存在多次调用 pandas.read_csv,性能太差了,想请教一个 python 大佬们有什么高效的办法

pandas.read_csv(target_file, skiprows=skip_rows, nrows=range, skipinitialspace=True) skip_rows = skip_rows + range

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所在节点    Python
14 条回复
lpts007
2021-02-07 16:36:41 +08:00
哪边产生的这种文件,让他改
sdushn
2021-02-07 16:44:26 +08:00
@lpts007 上下游都搞不定啊,难顶,只能自己处理了,又赶上鄙人不擅长 python T-T
starzh
2021-02-07 16:57:57 +08:00
或者先把文件切片再喂给 pandas,这样读取的次数会少一些
starzh
2021-02-07 17:00:57 +08:00
假如按照你的例子,字段从 A 到 L,那就把文件分成 3 个小文件,这样 pandas 就只用读 3 次,最后再把 3 个 dataframe 拼起来就好了
nano91
2021-02-07 17:06:29 +08:00
都在一个 csv 文件,那你一次性读完,然后筛不就行了,读完后 EFGH 被当成了行数据,这样的话,你把 EFGH 这种行数据给筛掉不就行了,再不济,既然你已经有 skip 的解决方法,就说明每个分片的长度是固定的,那就先转 list,[begin:end:skip]做切片然后转回 dataframe 不就行了
nano91
2021-02-07 17:07:48 +08:00
@nano91 dataframe 也可以直接切片,具体可以自己看看
learningman
2021-02-07 17:14:40 +08:00
换 C++预处理(
C++处理 csv 还算能写
sdushn
2021-02-07 17:15:01 +08:00
@starzh
@nano91
目前是计划先一次性读取,在给 pandas 之前处理好,按行读取,按分片逻辑把竖着的表处理成横着的,最后一次性给 pandas 转 dataframe
sdushn
2021-02-07 17:16:22 +08:00
@learningman 流下了没有技术的泪水,C++更不会写了
nano91
2021-02-07 17:23:09 +08:00
@sdushn 不用横过来,直接 dataframe 切片,每行就是一个元素
sdushn
2021-02-07 17:27:34 +08:00
@nano91 我去研究一下
cassidyhere
2021-02-07 23:29:14 +08:00
各位想复杂了,pandas.read_csv 有现成的 chunksize 参数
xchaoinfo
2021-02-08 09:52:18 +08:00
如果你用 Excel 应该怎么处理?
pandas 当成一个可编程的 Excel 。对比下,操作罗辑就很清楚了
Yinz
2021-02-09 17:17:56 +08:00
@sdushn #8 你的计划是对的,一次文件读取,处理成 dict (可流处理),转成 DataFrame 就可以了

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