Clustal

Definition / 释义

Clustal：一系列用于多序列比对（multiple sequence alignment, MSA）的生物信息学软件/算法家族（如 ClustalW、Clustal Omega），常用于比较 DNA/RNA/蛋白质序列并辅助构建系统发育关系。

Pronunciation / 发音

/ˈklʌstəl/

Examples / 例句

I aligned the protein sequences with Clustal.
我用 Clustal 对蛋白质序列进行了比对。

After removing low-quality reads, the researchers used Clustal Omega to generate a multiple sequence alignment and infer evolutionary relationships among the species.
在去除低质量读段后，研究人员使用 Clustal Omega 生成多序列比对，并推断这些物种之间的进化关系。

Etymology / 词源

Clustal 属于生物信息学领域的程序名/品牌名，常被解释为与 cluster（聚类/成簇） 和 (multiple sequence) alignment（序列比对） 的概念相关，强调把相似序列“聚在一起”并进行比对分析。该名称随后衍生出不同版本（如 ClustalW、Clustal Omega）。

Related Words / 相关词

• Alignment
• Bioinformatics
• BLAST
• ClustalW
• Clustal Omega
• MAFFT
• MUSCLE
• Phylogeny
• Sequence

Literary Works / 文学作品与出处

• Higgins, D. G. & Sharp, P. M. (1988). CLUSTAL: a package for performing multiple sequence alignment on a microcomputer.
• Thompson, J. D., Higgins, D. G., & Gibson, T. J. (1994). CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice.
• Sievers, F. et al. (2011). Fast, scalable generation of high-quality protein multiple sequence alignments using Clustal Omega.